En el siglo XVII, Jujuy se vio afectada por los levantamientos calchaquíes, en especial por los de 1630-1636 y de 1657-1666. Sin embargo, su ubicación estratégica en la vía de comunicación entre el Río de la Plata y el Alto Perú favoreció su desarrollo. Este mismo factor se hizo sentir a la hora de la lucha por la causa patriota: Jujuy se convirtió en escenario del enfrentamiento del Ejército Del Norte con las fuerzas realistas. La quebrada de Humahuaca fue uno de los principales teatros de operaciones bélicas. En julio de 1812, una delas invasiones godas puso en serios aprietos al ejército de Belgrano, que se hallaba sin recursos ni pertrechos. El creador de la Bandera dispuso que unos doscientos hombres mantuviesen a lraya a la avanzada realista, para dar tiempo al resto de la tropa a replegarse ordenadamente. La retirada debía ser total, de modo que no quedase mulas, caballos ni nada que pudiese servir a los "godos". El 24 de agosto de 1812, cuando Pío Tristán, el jefe realista, entró en San Salvador de Jujuy, se encontró con una ciudad desierta: el pueblo en masa se había marchado junto con los patriotas, realizando así una de las grandes gestas de la historia nacinal, la del "Éxodo Jujeño".
